La costruzione della stazione è stata un’occasione per riqualificare Largo Pignatelli, trasformando quest’ultimo, in una piazzetta con la progettazione di particolari banchine che ricordano gli scogli del lungomare e usando una maglia pavimentale tale che ricordano le onde del mare; il tutto adornato con la piantumazione di nuove essenze arboree.

Il viaggiatore idealmente inizia il suo viaggio dalle rive del mare, Largo Pignatelli, per imboccare le scale di accesso alla stazione ed entrare nelle profondità marine.

Infatti la struttura della stazione, formata da cinque differenti livelli con lunghezza di circa 100 metri ed un’altezza di 35 metri, ricorda un relitto di un vascello inabissato sul fondale marino.

I pannelli modulari che rivestono le pareti, opera dell’artista Peter Kogler, con il disegno creato dall’artista e avendo varie colorazioni di blu, restituiscono al viaggiatore l’impressione visiva della onde del mare. A quota biglietteria c’è una rete metallica gialla con posizionati dei videowall che evoca la vela del vascello. L’idea progettuale di Podrecca di ricordare un relitto inabissato continua con la simulazione di oblò sulle pareti del corpo centrale della stazione interamente in corten che hanno la funzione di illuminare il piano banchine.

Il piano ferro è profondo circa 26 metri dal suolo stradale e la stazione ha due binari su canna singola e due banchine laterali.

La stazione San Pasquale  fa parte del circuito delle “Stazioni dell’Arte” con il coordinamento artistico da parte di Achille Bonito Oliva con l’intervento del già citato artista austriaco Peter Kogler ed un intervento di finitura artistica ad opera dello stesso Boris Podrecca con l’applicazione sui quattro lati del torrino ascensore esterno di una lettera di Benedetto Croce.

Nell’anno 2025 la stazione San Pasquale si è aggiudicata il prestigioso Big See Architecture Award 2025.